VHL蛋白是Cullin RING E3连接酶的关键底物受体蛋白。它具有广泛的组织表达,并通过识别羟基化HIF-1α转录因子,充当缺氧应激反应的关键调节因子。
在常氧(高氧)条件下,HIF-1α在特定脯氨酸残基处被脯氨酰羟化酶 (PHD) 羟基化。这些羟脯氨酸标记可被 VHL 有效识别,VHL是E3连接酶CRL2的底物受体。一旦HIF-1α被招募到E3连接酶中,它就会成为泛素化和随后蛋白酶体降解的目标。
图1.化合物107(GNE7599):基于VH-021的SAR与类药性优化。
除了在调节缺氧应激反应中的作用外,VHL作为通过泛素蛋白酶体系统 (UPS) 进行靶向蛋白质降解的招募剂而引发了广泛的研究。基于VHL的异双功能降解剂(也称为PROTACS)是最常见的化合物之一。最近,一种基于VHL的BCL-XL靶向降解剂化合物DT2216进入临床研究(专利号:NCT04886622),用于治疗淋巴瘤和实体瘤。
此外,还报道了一种基于VHL的高效泛KRAS降解剂,能够降解多种KRAS突变体。虽然Cereblon (CRBN)和VHL-招募分子似乎同样适合作为降解剂,但VHL-招募降解剂可能更有效,因为在VHL-CRBN异二价降解剂的头对头比较中,CRBN被选择性降解。
然而,CBRN-招募酰亚胺配体及其衍生物具有更好的成药特性,例如口服生物利用度,从而解释了目前临床研究中对基于CRBN的异双功能降解剂的偏好。
在优化初始VHL配体方面已经做了大量的努力,许多专利证明了这一点,并在Diel等人的文章中进行了总结。第一个模拟肽的小分子VHL配体是基于与VHL/长链蛋白B/长链蛋白C (VBC)蛋白复合物结合的HIF-1α肽的共晶结构设计的。
如前所述,所有这些VHL配体目前面临的困局是效力适中、细胞渗透性低,因此口服生物利用度低,从而限制了作为口服生物可利用的基于VHL的异双功能降解剂的潜在应用 。
VHL配体作为拮抗剂的广泛使用,特别是在靶向蛋白质降解剂作为招募部分的背景下,促使研究人员鉴定出具有改善的口服生物利用度的更有效的分子,以加速走进临床造福更多患者。
PART.02
图2.用于优化 VHL 配体的总体策略
图3a:化合物 1−5 以及参考化合物 VH032 和 VH-021 的 VHL NanoBRET 表观解离常数 (KD app),单位为 μM(± 洋地黄皂苷细胞透化)
图3b:化合物 5 与 VHL 复合物的 X 晶体结构(PDB ID:9BJU)
图5a:与VHL复合的含4-环丙基-三唑的化合物104的晶体结构(PDB ID:9BOL)。红色虚线代表氢键相互作用,黄色虚线代表范德华相互作用,橙色虚线代表π−π相互作用
参考文献(可上下滑动):
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撰稿人 | 夕阳涂鸦 药渡
责任编辑 | 邵丽竹
审核人 | 何发
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随着敏捷开发和 AI 技术逐渐融入制药行业的合规管理,软件系统的定制化要求越来越高。本文主要从法规指南角度分析和评价定制软件验证的有效性。指导制药行业通过更加科学的风险管理手段开展验证,以实现系统选项、实施及测试过程的风险管控,保证后续运行阶段的 GXP 符合性。同时也满足《药品生产质量管理规范(2010 年修订)》计算机化系统 [1] 和《药品记录与数据管理要求(试行)》的要求 [2-3]。
作者:赵延武 程静 张文标 王军 张永秉
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