华中科技大学生命科学与技术学院郭安源课题组,近日在国际期刊《核酸研究》上报告了关于急性T淋巴细胞白血病中miRNA和转录因子共调控网络的生物信息学研究最新成果,并在此基础上与同济医学院教授孙军和协和医院血液科教授陈智超合作,对其中的核心调控模块进行了实验验证。
据了解,急性T淋巴细胞白血病(T-ALL)是一种恶性血液疾病,由未分化或分化很差的淋巴细胞在造血组织(特别是骨髓、脾脏和淋巴结)无限增殖所致,多发于儿童和青少年。尽管近年来多药联合、大剂量化疗等治疗手段不断改进,以及各类造血干细胞移植得到应用和推广,但是其治疗效果和预后比更常见的B细胞系淋巴细胞白血病仍然要差很多。目前,关于急性T淋巴细胞白血病的具体分子机理和调控机理还不清楚。
郭安源课题组以miRNA和转录因子的共调控角度为切入点,运用生物信息学方法,预测miRNA和转录因子与疾病基因之间形成的共调控前馈环模块,并由此构建共调控网络。通过深入分析该调控网络,研究人员获得了其中的核心miRNA和基因,并进一步对其中核心基因miR-19与CYLD在T-ALL中的分子机理进行了研究,首次揭示了miR-19抑制CYLD蛋白的产生,继而激活下游的NFKB信号通路,导致T淋巴细胞增殖失控。
该研究成果从系统网络水平上研究了急性T淋巴细胞白血病的发病机理和调控过程,为其诊断和治疗提供了理论依据,同时为复杂疾病的研究提供了计算和实验交叉的新思路和方法。
据悉,郭安源主要从事生物信息学和系统生物学在复杂疾病中的研究,包括数据整合、数据库构建、miRNA调控、比较基因组学和二代测序数据的分析研究等。
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本文以某制药产线的灌装机设备为研究对象,采用计算流体动力学(CFD)仿真技术对充氮装置的充氮性能进行分析,并结合分析结果对氮幕结构进行了优化设计。随后,针对优化方案进行性能仿真验证,结果显示优化后的顶空残氧量降低至0.252%。为了进一步验证优化方案的实际效果,将优化方案应用于实际产线进行性能测试,测得的顶空残氧量为0.68%,这一结果满足了小于1%的要求,表明其充氮保护性能已达到国际先进水平。
作者:王志刚、刘依宽、刘佳鑫
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