抗体的多特异性
抗体药物的多特异性是指抗体药物和非药物靶点发生的特异性反应(与脱靶效应类似)。
早在1990年,Stern和他的同事就发现单克隆抗β-淀粉样肽抗体可与外周血中人纤维蛋白原结合,可能原因是二者的构象同源性(文献1)。之后开展的临床前及临床试验显示,
多特异性会影响药物的PK,增加毒性的发生率
。
细胞株开发阶段进行多特异性筛选可能是最好时机
MAbs. Jan-Dec 2021;13(1):1999195.
除了序列同源性是比较容易理解和预测的多特异性产生因素,下面三个因素则比较难以通过模型或者实验进行预测。
分子拟态,即抗体可以与不同蛋白质结合,但是结合的蛋白质之间没有明显的整体序列同源性,仅关键的表位残基可能出现在一个完全不相关的蛋白质中。
Tucker等人的工作就证明了这一点,他们首先进行鸡体内免疫,使用体外噬菌体展示获得抗GLUT4抗体。结合能力分析,与膜表达的GLUT4表现出高亲和力,但与密切相关的人类GLUT1、GLUT2、GLUT3或小鼠GLUT1没有结合。但是对4571个受体的膜蛋白阵列筛选显示,与Notch-1的亲和力较低,但呈剂量依赖,为特异性结合。GLUT4和Notch-1蛋白同源性小于7%,但是抗体结合的关键残基GLUT4 (61-LGXXGP-66)出现在 Notch-1 (91-LGXXGP-96).
MLUT4抗体特异性结合NOTCH1(Proc Natl Acad Sci U S A. 2018;115 (22):E4990–E9.)
鉴于分子拟态是感染源逃避宿主免疫反应的共同特征,识别病毒和细菌靶点的抗体多特异性的风险更高。文献已经报道过几个这样的例子,包括结合心磷脂的抗HIV抗体,识别LYRIC蛋白的抗登革热NS1抗体,以及针对肌球蛋白的A组链球菌M蛋白的抗体。
第二种分子机制为CDR可塑性。抗体的抗原结合区域有多种构象,例如,4E10是一种广泛中和的抗HIV抗体,它针对包膜糖蛋白的膜近端区域的一个高度保守的线性表位,但发现可以识别自身抗原。
在寻找其结合的自身抗原时,使用了一个噬菌体展示肽库,在确定的前5个结果中,3个为1、2和3型肌醇三磷酸受体,它们都共享一个保守的肽序列基序。但该序列与MPER上的4E10核心表位完全不同,考虑和H-CDR3环构象灵活性相关。
“开放”和“闭环”构象的分子建模结果的比较(MAbs. 2020;12(1):1763138)
多特异性的第三个结构驱动因素并不依赖于共同基序或构象灵活性,而是通过VL和VH CDR的差异与两个不相关蛋白的相互作用。换句话说,根据他们结合的蛋白质不同,单个抗体可能有多个(潜在重叠的)功能抗体结合区域。
trastuzumab (Herceptin®)已被证明主要通过重链介导与人类表皮生长因子受体2(Her2)的相互作用。轻链中的突变获得了与第二个不相关的抗原VEGF的高亲和力结合的变异。结构和功能分析表明,这些变体之一bH1-44和两个完全不相关的抗原之间的相互作用是不同的,其特征是中心结合位点的构象适应。
值得注意的是,bH1-44重链上的两个突变足以敲除Her2的结合,同时保持与VEGF的高亲和力。同样,bH1-44轻链中的2个丙氨酸取代,破坏了VEGF的相互作用,而对Her2的接触没有影响。即使是最小的突变也可能导致如此显著的特异性差异,引入突变是不是需要慎之又慎?
简评:除了序列同源这一因素比较容易被预测,本文列举的剩余三个因素:分子拟态、CDR可塑性、以及突变引起的结合特异性改变,都不太容易通过模型预测。
责任编辑:胡静 审核人:何发
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