仅需四小时即可完成完整人类基因组测定——这在数年前听来仍如科幻小说情节,如今Roche正凭借SBX技术将其转化为工业现实。德国PROCESS杂志与罗氏化学生产负责人Roland Thiele博士、化学稀有试剂负责人Dieter Heindl博士展开对话,探讨了专为SBX技术新建实验楼的进展、化学原料生产中的挑战,以及Roche Penzberg基地作为创新中心所扮演的角色。
当Roche在Penzberg谈及纳米孔测序时,历史与未来在一处特殊地点交汇:昔日的矿井旧址。这里曾开采沥青煤,如今在Roche生物技术中心,一栋用于生产SBX技术所需化学原料的新建筑正拔地而起。这项全新技术被测序专家称为“扩增测序法”。选择在此建立集团内最大的综合性基地之一,理由十分明确:邻近创造协同。Penzberg实现了研发与生产的紧密衔接,在专业领域与部门间构建起高效的短途沟通路径。

一栋采用钢结构模块化建造的两层生产大楼正在施工:首层为833平方米的实验室区域,二层为630平方米的技术中心。(图片来源:Roche)
Part1 矿井旧址上的模块化实验楼
一栋全新的双层生产大楼正以钢结构模块化方式建造:首层设833平方米实验室区域,二层为630平方米技术中心。这栋建筑坐落于特殊地块——Penzberg旧沥青煤矿的Nonnenwaldschacht矿井旧址,该矿井现已注水并以混凝土回填。建设团队采用了创新方法:在同步推进建筑用地平整、加固与混凝土浇筑的同时,完成建筑模块的预制生产。这大幅缩短了整体建设周期,预计使用者将于2026年下半年入驻新楼。Roche为此项目投资约4000万欧元——相较于Penzberg基地的其他建设项目,这虽是一笔相对较小的投入,却具有极高的战略意义。
Part2 SBX技术补全Roche产品组合
2020年,Roche收购了发明SBX技术的美国初创公司Stratos Genomics。此次收购成为集团近年来最具雄心的技术整合计划之一。
Roche早已有测序市场布局,但此前一直缺乏自有测序平台。其现有产品矩阵涵盖样本制备用的“KAPA试剂”与“AVENIO Edge”系统、液体活检用的“AVENIO检测组合”,以及ctDNA分析方案。至此,Roche已能提供一体化测序解决方案的大部分组件——唯独缺少最核心的自有测序平台。通过收购Stratos Genomics,Roche得以将一款高效测序平台推向市场。
Part3 SBX技术原理:以化学方法突破物理极限
SBX技术的核心是一条“迂回”路径,巧妙化解了诸多难题:Roche并非直接测量纳米孔中紧密堆叠的DNA,而是检测其合成类似物——“扩增体”。其中的关键构建单元是X-NTPs。一种特制聚合酶能沿着原始DNA链连接这些X-NTPs,同时保留对侧DNA碱基的信息,形成长度扩展约50倍的分子。如此一来,每个微小碱基都转化为清晰可检测的“报告单元”,穿过纳米孔时会产生独特信号。每个报告单元在纳米孔传感区停留毫秒级时间,随后被电压脉冲推动前进,下一个报告单元则产生下一个明确信号。由于传感器包含约八百万个各带一个纳米孔的微孔板,测量得以大规模并行且高度可控地进行,最终实现每秒数亿碱基的检测速度。
Part4 产率从约2%提升至50%
扩增测序法不仅是巧妙的测量原理,其背后的化学修饰技术更具深意:经过化学修饰的特殊核苷三磷酸,质量是天然核苷酸的30倍。
X-NTPs的制备曾是最大技术挑战之一:一种关键前体最初仅能实现约2%的产率——这从经济角度看是无法承受的。Penzberg基地化学稀有试剂负责人Dieter Heindl博士在访谈中称之为“不可能完成的任务”,并解释道:“我们开发了一种前所未有的全新制备工艺,从而将产率提升至50%。”
研发过程中的第二大挑战在于终产物X-NTPs的纯度,因为在单分子检测机制下,任何痕量杂质都无所遁形。罗氏Penzberg基地化学生产负责人Roland Thiele博士表示:“我们现已实现绝对顶尖的纯度,这其中凝聚了大量技术专长。我们对市售通用的DNA合成仪进行了深度优化,使其如今能够满足极高的技术要求。”其核心逻辑十分明确:只有当合成化学工艺、原料纯度和稳定性均达到量产成熟水平时,SBX技术才能实现规模化供应。
Part5 四碱基对应四独立空间
SBX技术的成功离不开X-NTPs的高纯度保障。为此,必须对四种X-NTPs的生产区域进行严格的空间隔离,这是避免交叉污染的唯一途径。“新建筑使我们能够为四种不同的X-NTPs设置四个独立空间。每个空间内仅使用一套合成纯化设备生产单一产品。”Roland Thiele博士解释道。他同时指出这无需洁净室环境:“我们采用全封闭系统。关键在于产品本身的纯度,而非房间环境。”为保障缓冲液和溶剂的供应,项目还配备了一个与工厂供给系统相连的小型辅楼。容纳供暖、通风与空调(HVAC)系统的技术中心独占一整层,配备两台大型通风设备并采用正压通风系统——其占地面积几乎与生产区域相当。
Part6 数十年化学专业积淀
自1973年奠基以来,化学方法就在罗氏Penzberg基地的日常工作中扮演着核心角色——当时该基地还只是纯粹的药物生产中心。历经数十年发展,这里的专业知识体系已持续深化成熟。固相合成与点击化学——这两项SBX关键组件的核心制备工艺——如今已在Penzberg基地牢固扎根。这也正是在此投资建设专业实验楼的重要考量之一。
在Roche,研发与生产之间的技术转移被有意识地设计得既早且密。“这是一种历经多年、极为紧密的协作。”Roland Thiele博士强调道。来自生产环境的标准化质量参数因此得以在早期就反馈至研发流程,形成良性循环。
在线上访谈中,我们能清晰感受到这种紧密协作以及对SBX技术的澎湃热情。正如Dieter Heindl博士所描述的:“这是一个不惧风险、敢于挑战艰巨课题的团队。”Roland Thiele博士则补充道:“SBX确实给人科幻成真的震撼感。试想:我们制造DNA的合成类似物,以极高速度将其牵引通过纳米孔并读取信号——且是数百万次并行进行。”正是这种根植于数十年的化学专业积淀、卓越的生产能力、实践中凝聚的团队精神以及对技术可感的炽热追求,共同构成了驱动SBX技术在Roche成长为下一代测序突破的核心动力。
Part7 自动化与生产
Roland Thiele博士解释道,设备端的许多环节已实现自动化:“合成与纯化流程在自动化设备上全天候运行。”新的实验室生产大楼预计配备约15名员工,涵盖从化学实验员到博士学历的化学家等不同岗位。其中许多人来自Roche的固相合成部门,已具备相关工艺流程的内部专业知识。
Part8 13年对比4小时
在人类基因组计划中,全球科研人员首次利用Sanger测序法完成完整人类基因组测序,历时13年(1990年至2003年)。直到不久前,即便是最快速的全基因组测序等综合性基因检测仍需耗时数小时。如今,Roche的SBX技术显著提升了这一速度:由Boston顿儿童医院、Broad Clinical 实验室等机构与Roche紧密合作的研究团队,开发出一套极大缩短全基因组测序时长的工作流程。该团队对一份参考DNA样本的测序仅耗时3小时57分钟,创造了获得吉尼斯世界纪录认证的世界纪录。SBX技术从样本到结果的完整工作流程约四小时,其中测序环节本身仅需20分钟,扩增体合成约90分钟。这一速度本身固然令人瞩目,但其真正意义在于其能够快速提供遗传学答案的潜力。
Part9 肿瘤学、败血症与微生物组——SBX的精准临床应用
SBX技术明确聚焦临床需求,涵盖肿瘤学领域的液体活检与微小残留病监测、败血症等疾病的快速病原体鉴定,以及微生物组分析。“这100%契合客户需求。”Dieter Heindl博士表示,“客户需要的正是操作简便、速度迅捷、结果可靠的解决方案,而SBX技术能够全面满足这些要求。”搭载SBX技术的测序平台预计于2026年推出,初期主要面向研究用途,即“仅供研究使用”。
SBX正在重塑纳米孔技术的边界——其突破并非依赖更强的计算能力,而是通过化学方法从根本上简化信号读取过程。这一创新带来了高速测序能力、卓越的质量指标,以及一套专门设计的生产方案,从工业化层面解决了纯度这一“阿喀琉斯之踵(Achillesferse)”问题。尽管并非所有细节都已公开,但发展路径已然清晰——曾经带有科幻色彩的构想正逐步转化为标准化操作流程。
邵丽竹
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本文以某制药产线的灌装机设备为研究对象,采用计算流体动力学(CFD)仿真技术对充氮装置的充氮性能进行分析,并结合分析结果对氮幕结构进行了优化设计。随后,针对优化方案进行性能仿真验证,结果显示优化后的顶空残氧量降低至0.252%。为了进一步验证优化方案的实际效果,将优化方案应用于实际产线进行性能测试,测得的顶空残氧量为0.68%,这一结果满足了小于1%的要求,表明其充氮保护性能已达到国际先进水平。
作者:王志刚、刘依宽、刘佳鑫
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