科学家得到详细的恶性胶质细胞瘤细胞基因组数据库

2013-10-17

科学家启动了肿瘤基因组图谱计划,打算分析所有组织的肿瘤细胞的基因组.脑组织肿瘤是科学家的第一个目标,因为其挑战性大回报也最大.

科学家启动了肿瘤基因组图谱计划(The Cancer Genome Atlas，TCGA)，打算分析所有组织的肿瘤细胞的基因组。脑组织肿瘤是科学家的第一个目标，因为其挑战性大回报也最大。

TCGA收集了多形性成胶质细胞瘤(glioblastoma multiforme，GBM)的组织样本。来自14个研究所的一百多位科学家分析了GBM的基因组异常情况。相关报道发表在近期的Cell杂志上。

该文章的通讯作者Chin博士称，我们采用了先进的技术，收集大量的组织样本，非常细致的描述了胶质细胞瘤的基因组的变化。

科学家揭示了胶质细胞瘤的基因突变，缺失，重复;基因表达和表观调控;染色体结构，蛋白质组，分子网络等多种异常，该发现提供了深入的，更详尽的数据，为进一步的基础研究和临床研究提供了重要的基础信息。

该研究的另一位领导者Roeland Verhaak博士称，我们为GBM研究提供了巨大的资源，我相信我们的数据库最终会转化为GBM患者的福利。

该研究不但确认了之前发现的一些基因突变，如抑癌基因TP53，PTEN , RB1HE和原癌基因PIK3CA等，还新发现了61个突变基因。

Verhaak博士指出在这些新发现的突变基因中，BRAF和FGFR有望是最有临床价值的。科学家已经开始在研究针对这些基因的药物。胶质细胞瘤的BRAF突变在黑色素瘤中也经常出现，已经有新型药物针对该靶点。

最新研究发现了一些重复或缺失的基因。如最常见的基因重复是七号染色体上的表皮生长因子受体(EGFR)的重复。

GBM疾病中EGFR重复，突变都经常发生，但是针对EGFR的药物却疗效甚微。Verhaak博士称，EGFR的变化频率比我们想象的要高。在57%的肿瘤中，EGFR会发生突变，重排，重复等各种变化。

Verhaak博士称，针对EGFR的治疗还是很有前景的，但是首先要揭示EGFR不同类型的改变对GBM发病的影响。

Verhaak博士近些年通过基因表达将GBM进行分类。现在主要分成四类：神经元型，神经元前体型，间质细胞型和常规型。科学家希望通过DNA甲基化，信号通路活性和各种临床指标来分类。了解这些不同类型能够更好的指导临床治疗和开发新型药物。

科学家发现神经元前体型GBM患者的生存依赖于G-CIMP基因的甲基化。而MGMT基因的甲基化或可作为治疗常规型GBM的生物标记物。