Nanopore Day上海研讨会圆满完成

作者:本网编辑 文章来源:PHT《制药业》 发布时间:2018-04-17
Oxford Nanopore Technologies自3月20日宣布获得1亿英镑的融资后就一直是业界所关注的焦点。

2018年3月26日,致力于开发基于纳米孔科学的突破性、单分子、电子传感系统的公司牛津纳米孔技术(Oxford Nanopore Technologies)在上海举行的Nanopore Day研讨会圆满完成。

 

在本次研讨会上有:CEO Gordon Sanghera亲自到场演讲;销售总监Louisa Ludbrook博士介绍纳米孔产品概况和新开通的中国销售渠道;临床医学和转化研究的Leila Luheshi博士展示MinION在埃博拉和寨卡病毒的基因测序监控, 病原体、抗病原微生物检测的应用实例;还有嘉宾经验交流分享:英国东安格利亚大学的Justin O’Grady博士,上海东方医院的吴文娟医师,先声诊断的涂浩波博士,贝康医疗的王剑青博士,和未来组/希望组的汪德鹏博士。

 

Oxford Nanopore Technologies自3月20日宣布获得1亿英镑的融资后就一直是业界所关注的焦点。近日,Oxford Nanopore在北京、上海、广州三地进行了首次中国Nanopore Day系列研讨会,旨在向纳米孔用户提供一个经验交流和技术分享的平台。继北京研讨会的成功举办,在上海的会场也是惊喜多多,精彩内容不断。

 

研讨会开场首先由CEO Gordon Sanghera进行了演讲,讨论了对中国市场的期望和信心。Oxford Nanopore研发的MinION是世界上首个、也是唯一一个便携式、实时纳米孔DNA/RNA测序仪。Nanopore测序在2017年末进驻中国,目前正以飞快的速度发展和兼容更多、更新的应用。这些应用可能包含人类基因组测序、癌症基因组和微生物学/传染病的分析,以及在工业方面的应用,如食品安全、环境监测或科学教育。公司目前正在推出具有更高通量的设备—— GridION X5和PromethION。PromethION能与世界上最高通量的测序仪器匹敌,具有开展大型人类、动物和植物测序项目的能力。过去的DNA测序,与90年代时谈论计算机技术很相似:机器庞大笨重、操作流程复杂、费用高额。即使在今天,如果独立进行DNA测序的话,仅是仪器购买就可能花费25万到上百万美元不等。即使是花销在5万到25万美元之间的设备,设置也是非常“中心化”的——测序不仅需要在实验室环境下操作,对基础的IT设施也要求很高。这样一来,整个测序花费可高达几百万美元。全球现在共有12500台大型主机测序仪,从历史的角度来看,它们就像80年代中期的大型电脑主机。而如同大型计算机主机已经逐渐发展到台式机、手持式、再到可穿戴式一样,现在DNA测序设备也在往更小型的方向发展。我们的用户可以花很少的成本,就能使用我们所有的设备进行测序。在高门槛被打破后,任何人都可以利用我们的装置进行测序,并且可以依据需要选择大小。

 

“我们的目标是让任何人都能在任何环境下分析任何生物。我们的技术能够被广泛应用,除了用于寻找病毒种类监控病源,比如追踪埃博拉病毒等,也被应用于农业方面和教育方面,教育领域的应用主要针对遗传学和生命健康方面。大家都很熟悉物联网(Internet of Things)的概念,它说的是所有的事物都能被互联网联系在一起,并能够通过你的智能手机控制。所有生物都有DNA,我们可能会好奇它们是什么类型的DNA,是否在发生变化、是否健康等等。你可以设想“生物物联网”(Internet of Living Things)这样的一个概念,即我们可以对DNA进行实时测序,并得到即时的结果反馈。我们是全球唯一一家能够做到实时测序的公司。例如,现在就有一种病毒正在攻击在非洲和其它一些国家都很受欢迎的作物——木薯。科学家们就在实地利用MinION鉴定病毒种类,研究提高作物产量的战略性措施。如果拥有实时的DNA信息,就可以实现“生物物联网”(Internet of Living Things)。因此,我们公司的目标就是让任何人、在任何地方都可以获取DNA信息。”

 

Oxford Nanopore Technologies对中国市场有着很高的期望和信心。我们认为中国是开发基因组创新应用的最具创新性的市场之一。从2018年4月起,Oxford Nanopore Technologies将会向中国客户提供完整的中文客服和技术支持服务。而也这将会是Oxford Nanopore Technologies在中国实现本土化的里程碑。

 

北京希望组生物科技有限公司CEO汪德鹏先生表示,我们觉得三代测序在精准医学的机会将会是在遗传病、肿瘤、微生物这三个方面,而且我们认为三代测序技术在今年会达到应用层面。我们已经做了几十个动植物的基因组,也做了几十个人的基因组,一直在做各种各样的尝试。三代测序作为应用将会需要一点时间,但有望随着PromethION的推出,能够使中国走在全世界测序应用行列的最前端。另外我们确实也成为了Oxford  Nanopore在全球最大的客户,去年我们也是PacBio最大的客户。但在两者间切换进行比较之后,我们发现Oxford Nanopore有着非常明显的优势。它的成本将马上会低于二代测序,而一台机器可能能够产生比二代测序更多的数据量。这就意味着三代测序可能在接下来的两三年成为主流的测序手段,因此我们也毫不犹豫地在朝着这一方向努力。在这个过程中,我们也遇到了一些挑战,也一直在和Gordon Sanghera他们进行积极地探讨。尽管技术还并不完美,但它到目前已经解决了大量的不足之处,尤其是在通量、成本和速度上。我们北京希望组一直在做三代测序和精准医疗的开发,武汉希望组一直在做动植物组、微生物的科研,在这两个方面我们都走在了全世界应用的前列。在每个项目中我们都能找到纳米孔测序的优势和不足。 当然,从另外一个角度来讲,并不是说PacBio平台就没用,它可能应用在某些领域会有用,但不会是主流的,只能作为辅助手段。接下来Oxford Nanopore和Illumina可能会成为整个测序行业的两个巨头,而整个市场将成为多元化的市场。

 

江苏先声医学诊断有限公司产品总监涂浩波先生言及,先声诊断是先声药业集团下属的诊断子公司,于2017年成立,和Oxford Nanopore有着长期交流和合作的基础。基于对Oxford Nanopore这一平台的认识,在子公司的成立初期,我们就决定利用这一平台开发能够应用于感染疾病领域的、造福病患和医务工作者的精准快速的诊断方案。我们希望能够通过这样的一个方案,做到缩短感染性疾病的检测周期,提高鉴定的准确度,甚至能够对未知病原体进行检测。 目前,我们利用Oxford Nanopore这一技术平台积累了很多的数据和分析比较,发现它较其他测序平台有着巨大的优势:第一是长读长,这对于微生物鉴定有非常大的帮助;第二是它可以实时检测、实时分析;第三是它的便携性,世界上没有第二台这样的能够应用在市场上的便携测序仪。利用这种便携性优势,我们可以在临床医院进行床旁检测,甚至可以在国家应急监控中做到实地、实时鉴定和分析疫情爆发的源头。因此,它在感染性疾病诊断方面有着很大的应用价值。随着我们与Oxford Nanopore之间的不断合作,我们也在坚定的向着这一方向和道路前进。我们预计在今、明两年会与Oxford Nanopore有更进一步的合作,推出一些重磅性的、能够为临床患者提供检测的服务。最终我们希望能够做到对这些产品进行CFDA注册报批,这就是我们目前的状况以及对未来的规划。

 

目前,Oxford Nanopore的所有产品均还在仅供研究使用的阶段,我们也严格要求客户遵守规定,仅将产品用于科学研究。

 

最后,Gordon Sanghera先生补充道,“中国作为一个大国,正在快速的吸纳基因技术。目前全球共有12500台大型主机测序仪,自2015年以来,我们已经发出了6000个MinION产品,我们预计半年内会有1000-2000个MinION发往到中国。因为一千美金的价格对于做DNA测序的人来说非常便宜。而这样可以实时测序、并实时出结果的技术,在中国这样一个善于接受创新技术的市场也很受欢迎,所以我们认为中国市场很有发展前景。”

 

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