快速分析医学论文 IBM超级计算机加速新药研究

发布时间:2014-09-04
IBM华生(Waston)认知运算技术已经协助医师、信贷人员、企业以及甚至退伍军人等各行各业找到许多复杂问题的答案了。

IBM华生(Waston)认知运算技术已经协助医师、信贷人员、企业以及甚至退伍军人等各行各业找到许多复杂问题的答案了。对于华生超级计算机来说,下一个重大挑战在于协助研究人员探索更多的未知。

IBM公司日前宣布,其Watson Discovery Advisor技术现可提供云计算服务。贝勒医学院(Baylor College of Medicine)与IBM公司看好华生在数据备份研究方面的价值,最近发布一份经同侪审查的研究,在 Watson Discovery Advisor 的协助下,针对癌症研究提出6种值得深入探讨的研究路径。

作为贝勒研究的一部分,华生超级计算机分析超过7万份有关p53的科学论文——p53是一种涉及多种癌症的蛋白质。透过华生实现了自动分析,有助于贝勒医学院的生物学家与数据科学家找到6种可改善p53的蛋白质,可望展开更深入的新研究。据IBM表示,更重要的是,这次的发现只花了几周的时间。

“在生命科学领域,研究人员们通常要花一年的时间才能找到一种有关的蛋白质,”IBM华生副总裁John Gordon说。“Baylor与华生的合作发现了6种蛋白质,前2种蛋白质已经得到实验室的验证了,因而已大幅超越业界的进展。”

随着快速且低成本的DNA分析技术突破,大幅加速了近几年来的生医研究步伐。此外,包括辉瑞(Pfizer)、诺华(Novartis)以及其他多家主导药厂经常发现在基因组、临床试验以及无法确认的电子病例之间存在着相关性。根据IBM表示,华生超级计算机之所以表现非凡之处在于其对于其理解语言与化学的认知运算能力,能够以计算机分析速度实现类似人类般理解能力的飞跃性进展。

“人们已经发现其中不同数据组之间的相关性,但由于华生能够理解概念以及解释研究方向,因而能够揭露更加微妙的关系,”Gordon表示。

例如,研究论文不只证实蛋白质是否与p53有关、归纳出简单的二进制结论,还得探索这些蛋白质是否加快或抑制基因突变,以及是否可能促进化学过程。如今,要消化这70,000篇研究论文更进一步提高了挑战。

“即使我一天读五份文件,也得花费将近38年的时间才能完全了解目前针对这种蛋白质的所有研究,”贝勒医学院分子学与人类遗传学、生物化学与分子生物学教授Olivier Lichtarge表示,“华生显示拥有巨大潜力,能够为突破性发现提高速度与质量。”

IBM并宣布,制药巨擘Johnson & Johnson已与华生合作加速这些研究计划。Johnson & Johnso与Discovery Advisor团队合作,开始教华生阅读以及理解科学论文,详细探讨用于评估治疗的临床试验结果。这些合作单位都希望能加速药物的比较效益研究。Sanofi则希望加快药物的再利用,找到现有药物的其他适应症。

在认知运算的其他新应用中,IBM表示其针对客户支持中心的应用——Watson Engagement Advisor服务已经获得USAA采用。USAA是一个为美国军人退役回归平民生活时提供各种财务建议与生活咨询的网络与行动支持选项。

Watson Discovery Advisor 云端服务首先将针对生命科学应用,但IBM表示,它在法律、教育、化工、冶金以及其他科学领域也拥有改善相关研究的潜力。

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