中国科学院微生物研究所朱宝利教授领衔的课题组对来自丹麦、西班牙、中国的162个健康人肠道微生物元基因组中的耐药基因进行深入分析后发现，在上述3个国家人群中，四环素耐药基因所占比例最高。欧洲20个国家近10年抗生素的使用中，四环素类抗生素在动物中的使用量(包括畜牧养殖)显著高于其他抗生素，而临床上使用量很少。研究人员提出，环境中抗生素滥用或导致临床耐药风险增加。该研究论文日前发表在《自然》杂志子刊《自然通讯》上。

人体肠道中栖息着种类繁多的微生物，其数量超过人体自身细胞的10倍以上。这些微生物的基因组中蕴含大量的遗传信息，被称为人体的第二个基因组。有研究者认为，人体肠道微生物是抗生素耐药基因的“储存库”。

朱宝利课题组首先建立了一个含有400万个人体肠道微生物基因的数据集，随后从中鉴别出1093个耐药基因。通过与其他8个不同环境基因组的比较发现，人体肠道微生物中耐药基因的比例最高。此外，耐药基因更倾向存在于某些特定类型的细菌中，如变形菌。

研究人员将1093个耐药基因分成149个不同的耐药基因型，通过多种方法研究发现，中国人肠道微生物耐药基因所含比例最高，西班牙人居中，丹麦人最低;中国人肠道耐药基因不同于丹麦和西班牙人，这种差异可能与肠道菌群差异以及不同地域抗生素使用的偏好不同有关。遗憾的是，研究人员没有拿到中国抗生素使用情况的官方数据。

研究人员指出，抗生素的滥用和过度使用无疑将富集或诱导出各种类型的耐药基因，这些耐药基因可能通过多种途径(如食物链)最终传递到人体中，极大地增加了含有耐药基因的细菌将耐药基因转移到不含耐药基因的细菌中的风险。一旦某些耐药基因转移到人体病原菌中，将使临床抗感染治疗面临更多挑战。