二代测序离你远吗?如果当你在好莱坞大片中看到罗氏454测序仪的时候,你一定会在惊呼原来DNA测序技术就在你的身边,而且与你的生命、健康息息相关。由好莱坞导演史蒂文•索德伯格指导,由马特•达蒙、玛丽昂•歌迪亚、凯特•温丝莱特、裘德•洛、格温妮丝•帕特洛等主演的影片“传染病(Contagion)”于9月9日在美国上映。影片讲述了一种靠空气与接触就能传播的致命病毒,几天之内它就席卷全球。世界各地的医疗组织争分夺秒的研究病毒来源以及抗体,而普通人则为自我的生存做殊死挣扎的故事。454测序仪现身影片中协助最终鉴定出病毒的来源与种属。
回到现实生活和实际研究中 ,罗氏454二代测序系统由于其长读长特点,在微生物的全新基因组测序拼接领域,以及宏基因组研究应用领域的优势让它成为研究人员进行病原体鉴定的重要实验工具,尤其是应对突发性爆发性流行事件。GS FLX+系统可达1,000 bp的单个读长以及Junior系统400 bp的单个读长,依赖于454的长读长技术,科研人员进行快速病原生物基因拼接,未知病原体鉴定,鉴别亲缘关系相近的病原生物。
赛默飞世尔公司郑重声明:2011年度NanoDrop品牌的2000及2000C产品已授权给基因有限公司(Gene Company Limited)。对于市场出现的非基因有限公司(Gene Company Limited)经营的本公司产品,本公司概不负责其仪器质量以及相关售后服务保障。
五位来自世界各地的研究人员,哥伦比亚大学的Ian Lipkin教授、Tahoe研究中心的Evan Skowronski、香港大学的Si Lok、国际家畜研究学院的Steve Kemp以及巴西Evandro Chagas研究所的Marcio Nunes 现身说法 ,阐述了罗氏454系统在其实验研究中的应用,相关内容专门拍摄成了一部20分钟的名为“Microbe Hunters: The Science of Pathogen Detection”的短片。
哥伦比亚大学的Ian Lipkin作为正式影片传染病(Contagion)的专业顾问,作为传染病研究专家,介绍了该领域近年来的技术发展。香港大学的Si Lok教授回顾了他们利用GS Junior系统快速鉴定今年爆发的猩红热病毒。Tahoe研究中心的Evan Skowronski阐述了该机构在菲律宾的两个分支机构在最近爆发的两次疫情中的工作。国际家畜研究学院的Steve Kemp利用454系统在肯尼亚开展人畜共患疾病的研究,而巴西Evandro Chagas研究所的Marcio Nunes则介绍了热带丛林中各种病原体的检测工作。
除此之外,一个关于病原体发现鉴定的网络研讨会也已经举行,相关内容和讲稿敬请留意后续报道。
罗氏454系统旨在成为可信赖的病原生物发现与检测系统,协助医疗专家预防和应对各类流行病事件。随着二代测序技术的不断发展,测序技术的应用将深入到科学研究以及医疗诊断预防的各个领域。我们当然不希望电影“传染病”中的情节真实发生,但在这种可能出现之前 ,你是否希望拥有一台如同电影中一样的测序仪,获得可靠而有帮助的数据呢?
454是二代测序技术公司,使用焦磷酸测序的基本原理,将测序仪优化为可达1Kbp单一序列读长的测序平台,以其长序列读长测序保持着在领域内重要的应用地位;2007年位于美国Branford 的454公司被罗氏收购,整合至罗氏诊断应用科学部,成为重要的产品线之一,为探索新一代测序技术在人类健康事业中的应用而奋力前行。
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