面对越来越多的突发疫情,我们该如何应对？

文章来源：生物通发布时间：2011-06-30

今年5月源于德国的大肠杆菌疫情,目前该疫情已导致25人死亡,642人出现严重并发症及致肾功能衰竭,确诊感染病例高达约2500起.面对越来越多的突发疫情,我们该如何应对？Illumina MiSeq帮助您在第一时间深入了解疫情,以作出正确的决断.

今年5月源于德国的大肠杆菌疫情，目前该疫情已导致35人死亡，773人出现严重并发症及致肾功能衰竭，确诊感染病例高达约3255起。深圳华大基因的研究团队，使用Illumina公司的新一代高通量测序系统完成了第一个真正意义上的该大肠杆菌基于de novo测序的组装结果，比早前发布的版本更加完整，并且修正了之前可能出现的组装错误。

Illumina即将推出的MiSeq系统，非常适合此类突发疫情病原体的确定和监控。

• 一天内可以完成包括文库制备、SBS（边合成边测序）测序、数据分析的整体实验流程，第一时间确认病原体。
• 对于越来越复杂的细菌和病毒的变异情况，de novo测序是确认病原体所必须的。MiSeq一次运行可产生1－1.5Gb数据结果，一次运行的数据量即可完成de novo组装。
• 具有大量文献验证的SBS（边合成边测序）技术原理，适合处理复杂的基因组测序，即使是连续的重复碱基的测序也不会出现任何问题。
• 使用双端对读测序，可产生2 X 150 bp测序读长，便于de novo组装。
• 操作便捷的台式仪器，从簇生成、测序反应到数据分析，都可以在一台仪器上完成，只需要20分钟左右的手动操作，适合任何实验室应用。