近日，德国肠出血性大肠杆菌疫情有所缓解，新增病例逐渐减少。然而，在法兰克福附近的一条小溪中检验出肠出血性大肠杆菌，以及该病菌可通过人体污染食物并感染他人等情况，却增加了人们对病菌向自然环境中扩散的担忧。

6月17日，黑森州环境部的调查人员经检验确认，在法兰克福东北部的艾伦巴赫的一条溪流中发现肠出血性大肠杆菌。起初调查人员是在检测溪流附近农场中的生菜时发现类似的大肠杆菌，后来才从溪流的水样中发现致命的O104：H4病菌。截至目前，这条长达30公里的溪水中的病菌的来源仍不清楚，溪流没有污染当地的饮用水源，该地区也没有新增肠出血性大肠杆菌感染病例的报道。不过黑森州已告诫民众不要在当地河流溪水中游泳，从小溪中取水的农场也已被关闭。

6月18日，在德国卫生部部长巴尔造访明斯特大学医院卫生研究所时，该研究所所长黑尔格•卡希教授表示，许多感染者目前正在通过排泄物排出病菌，因此，对于在水中发现肠出血性大肠杆菌的情况，他并不觉得奇怪。环境中可能会出现更多的肠出血性大肠杆菌，防疫部门应尽早就如何持久消灭病菌制定对策。对此，德国联邦风险评估研究所6月18日也发表公报称，肠出血性大肠杆菌可通过不同途径进入公共水域，有些病菌感染者在自己还没有出现任何症状时，可能已经在无意中通过排泄物传播了病菌。

卡希教授的研究团队率先确认O104：H4型大肠杆菌是此次德国暴发的疫情的元凶。他们的研究表明，这种肠出血性大肠杆菌具有很强的聚集黏附能力，还会形成黏膜，病菌在里面可以存活较长时间。此外，研究人员还发现，这种病菌有很强的抵抗外界影响的能力。它可以长时间经受酸性环境，并且耐寒能力也较强。在该实验室的冰箱中，病菌样品在5摄氏度的低温环境下已经存活了数周。

此前，德国黑森州政府于6月17日宣布，该州通过实验室检验确认，一位自身感染了肠出血性大肠杆菌但当时还没有出现明显病症的食品餐饮公司雇员，在准备食物过程中将身上携带的肠出血性大肠杆菌传播到了食物上，导致65位就餐的顾客中有20人感染了肠出血性大肠杆菌。此事虽然不能消除芽苗菜可能是病菌传播源头的嫌疑，但却可以帮助研究人员调查病菌传染途径。

据德国负责监控全国疫情的罗伯特•科赫研究所6月17日公布的疫情通报(数据截止时间为6月16日15时)，德国肠出血性大肠杆菌感染病例累计已达3408例，其中溶血性尿毒综合征重症病例(HUS)有798例，死亡病例为38例。