2009年4月20日,加利弗尼亚州圣地亚哥市和圣克拉拉市--Illumina公司(NASDAQ:ILMN)和安捷伦科技(NYSE:A)于当天宣布,他们已经启动了一个非排他性的合作市场营销协议,旨在支持一项可以帮助研究人员进行靶向测序研究,全新的并且可扩展的解决方案。Illumina的Genome Analyzer是一款已经获得了广泛认同的新一代测序平台。安捷伦的SureSelect靶向序列捕获系统,针对该平台进行了特别优化,为研究人员提供了一种可以对基因组中感兴趣的特定区域进行有效测序的方法。这种低成本高效益的方法,不仅大大简化了实验室的处理过程,而且同时提供了测序数据的均一覆盖度和高可比对率。安捷伦的SureSelect靶向序列捕获系统与Illumina的Genome Analyzer的组合应用,可以让研究人员突破技术瓶颈,从事以往无法进行的研究。
在美国癌症研究协会(AACR)本周于科罗拉多州丹佛市召开的会议上,Illumina和安捷伦突出展示了他们联合推出的解决方案的优点。这一新的研究方案,帮助研究人员在得益于起始样品量要求很低优点的同时,还能够检测多个感兴趣的区域,从而检出罕见的基因突变(如在癌症中常见的突变)。靶向测序技术,也使研究人员除了可以对候选基因和候选区段进行测序外,还可以对全基因组关联研究中确定的区域进行测序。
麻省理工学院Broad研究院的基因组测序和分析项目主任Chad Nusbaum,在2009年2月的Nature Biotechnology杂志上介绍了安捷伦SureSelect采用的杂交选择技术(论文联接):"我们开发了一种杂交选择方法,用于捕获基因组的特定序列。该方法具有灵活性、可扩展性和高效率的特点。基于杂交选择的靶向捕获,在很多应用领域可能极为有用。例如,对受到无关DNA严重污染、珍贵、保存久远的DNA的捕获,对临床样本中病毒群体的深度测序,或对环境或医学样本的宏基因组学分析等。"在上述这些应用中,如果选择传统的单重PCR方法,可能费用过高或者通量过低。
"我们与安捷伦的合作强调了我们将新一代测序技术推向应用的承诺,帮助研究人员用以往不可想象的规模化来计划并实施研究工作。"Illumina公司总裁兼首席执行官Jay Flatley说:"我们将不断扩展我们的解决方案系列产品,提供更多可用于基因组变异研究的强有力工具。这个解决方案为研究人员提供了一种低成本、高效益、易于自动化而且灵活的靶向测序方法,完全可以适用于多种不同的应用领域。"
"安捷伦SureSelect靶向序列捕获系统,只需要新一代测序操作流程中已有的标准设备,就可以运行。"安捷伦科技副总裁兼生命科学事业部总经理Nick Roelofs博士说,"安捷伦是市场上唯一一家能够准确、可靠地定制生产含有100个以上碱基对的寡核苷酸的制造商。SureSelect平台凭借安捷伦的这一独有能力,能够高度特异地捕获基因组变异。通过SureSelect与Illumina Genome Analyzer的联合应用,研究人员可以自行设计实验,利用Illumina的读长能力,获得及时、可重现的结果,并同时降低成本和提高耐用性。 SureSelect系统,使研究人员能够方便有效地通过eArray探针设计工具完成自定义设计,并且可以结合自动化系统以获得更高的可扩展性和成本效益。"
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