对药物或小分子化合物能调制哪些蛋白靶位点的研究突破受到诸多因素的制约,包括靶蛋白的表达水平、化合物的有效浓度以及化合物对靶蛋白产生干扰所需的时间。目前所用的多维表型仿形法的一个局限之处是通常只选择一个时间点来评估化合物的效应。因此,依照该方法得出的化合物作用机理相关结论仅仅是基于处理样本的具体时间点。
为克服这些局限性,Abassi等1研究人员开发出一种活细胞效应曲线方法,用于动态监测小分子化合物的效应,该方法采用罗氏应用科学部的xCELLigence系统,可实现对细胞的实时监测。该方法通过筛选一个包含FDA批准药物、实验化合物和天然化合物的药库中进行了测试。活性相近的化合物产生的基于阻抗检测的时间依赖性细胞效应图谱(Time-depended Cell Response Profiles, TCRPs)也很相似;根据TCRP的相似性可将化合物分为不同的群集。
通过该项技术研究人员已鉴定出了现有药物的新作用机理,除了对之前报告的COX-2 抑制剂Celecoxib的钙调制活性进行了证实外,同时也还发现实验化合物 Monastrol的另一种机理。 研究人员还识别出一种新的抗有丝分裂剂,并对其特征进行了定义描述。这种方法还将有助于检测某种特定的化合物的脱靶效应。
由Abassi 等人描述的TCRP技术有效地克服了当前普遍使用方法在时间依赖性上的局限性。在与细胞数量、形态和黏附力一起结合使用时,TCR技术能显著扩大所筛查的化合物的"生物空间"。该技术为检测和识别小分子相关的生物活性提供了充分的机会。
总之,这些研究成果表明,由TCRP法提供的基于时间的解决办法可以与表型仿形法搭配使用,以获取小分子化合物相关的更多数据。TCRP法可为小分子化合物提供预测性的机理信息。
关于无标记细胞检测技术
作为无标记生物检测技术领域的一项创新,罗氏应用科学部的xCELLigence系统提供一种无需标记、同时又可对细胞进行实时监测的新型细胞分析检测平台。细胞接种在E-Plate微孔板中,在每个孔的底部有嵌入的微电子感应器,微电极阻抗主要由点及周边的离子环境决定,当电场加在上面的时候可以测量到一个基线阻抗,细胞的有无、形态以及贴壁程度的改变都会影响电极传感器表面电子和离子的通过。因此,细胞在E-Plate微孔板检测板上的贴壁、黏附、生长等状况与传感器所测量得到的阻抗相对应。根据阻抗得到的指数,反映了细胞增殖、存活、凋亡、形态变化等细胞生物学状态。
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