今年上半年，欧盟仍为我国医药外贸第一大伙伴，双边进出口总额高达15.12亿美元；其中我国自欧盟进口达37.56亿美元，同比增长18%；对欧盟出口达37.55亿美元，同比下跌6.7%。由于进口大幅增长，出口有所萎缩，中欧医药贸易多年来首次出现逆差。
据中国医药保健品进出口商会（下简称医保商会）副会长刘张林介绍，出现逆差的原因有三个方面。首先，国际金融危机尚未显出触底的迹象，其对全球医药产业的影响已经初步显现，各大跨国制药企业为缩减成本和提高生产效率，开始普遍紧缩支出、重组内部机构、调整研发重点、暂缓上马新项目等，我国的外包和原料药企业深受其不利影响；其次，欧洲医药企业加大了在亚洲等新兴市场的销售力量，力求占有更多的市场份额，以减缓金融危机的不利影响；再次，我国医改新政将直接带动内需的放大，大量关键医疗设备与技术以及质优价廉的西成药、生化药等的进口量势必上升。
从目前来看，此次逆差有两个表征。一方面，由于医改的推动，医保产品进口大幅增加；另一方面，由于金融危机的影响，中成药、保健品和部分医疗器械产品的出口规模出现萎缩。
据刘张林介绍，我国医改新政将直接带动内需的放大，大量关键医疗设备与技术以及质优价廉的西成药、生化药等的进口量势必上升。据记者了解，近年来，我国不少三甲医院进入设备更新期，对国外高端医疗设备的需求将保持一定增长，预计全年进口可望增加。此外，欧元贬值，国际能源以及大宗原材料价格回落，许多欧洲企业很可能通过低价方式向我国输出更多的产品与技术，以尽快实现资金回笼，确保企业的基本运转。而国内企业会借助这一机遇，扩大医药产品进口，用于产品和设备更新，提高生产效率和自主研发水平，为产业升级准备基础条件。
医保商会对今年出口形势的预测表明，中成药、保健品和部分医疗器械产品的出口将会受阻。2008年，我国中成药进出口出现了13年以来的首次逆差，而这一现象很可能在今年得以延续，这主要是国际消费者对保健类产品的需求萎缩所致。不仅仅是中成药，一些相关的保健品和用于康复、理疗用途的按摩器具产品出口也会受到较大阻力，这些领域的企业可能较其他领域更能体会到来自金融危机的寒流。