近年来深圳市药监部门与香港高校加强了技术合作。市药品检验所与香港科技大学共建了港深药物研发检定中心，市药检所还成为了香港科技大学中药研发中心深圳基地。
据介绍，港深药物研发检定中心定位于集天然药物研发、药品质量标准研究、检验检测、人员培训及资讯服务为一体的高科技研发检定中心，充分利用香港科技大学中药研发中心在新药筛选、临床前试验、标准制订等方面的人才、技术优势，建立药物研发创新平台；充分利用深圳市药品检验所在中成药非法添加化学药物成分筛查、重金属含量测定、有毒元素检测以及动物急性毒性试验等方面的人员、仪器和成本优势，快速搭建药物检测服务平台，为深港两地医药研发、生产机构提供与药品检验和分析相关的专业技术服务。
双方率先在天然药物有效成分研发、贵重中药评价体系、非法物质添加筛查等方面展开广泛深入合作。深港创新圈课题：“中药及保健食品中非法添加化学物质检测技术平台与信息检索平台的开发”，经过课题组成员的一年来的努力，已建立了非法添加筛查方法17个，涵盖了中药及保健食品中非法添加降糖类、减肥类、镇静安眠类、糖皮质激素类、补肾壮阳类、降压类、胃药类、降血脂类等8大类化学物质的筛查方法，为净化我市的中药及保健食品市场做出了贡献。
近日双方又合作利用化学指纹图谱、基因组学、蛋白组学对冬虫夏草、石斛、川贝、燕窝等贵重药材的生物功效及分类进行研究，建立客观、科学且具权威性的鉴别方法，并准备开发快检鉴别试剂盒。
记者在采访中了解到，前不久，经香港卫生署批准，深圳市药检所成为国内第十七个承担香港地区中成药注册检验机构，正式受理香港地区中成药的注册检验业务。